U zasadima pod breskvama i nektarinama proređeni plodovi nesmetano rastu. A da bi se krupni, zdravi i sočni i brali, valja ih sačuvati od parazitnih gljiva prouzrokovača bolesti i štetnih insekata. Najčešće prisutna gljiva je prouzrokovač šupljikavosti listova, a najštetnija je monilija – izazivač sive truleži ploda. Na nektarinama ne treba zanemariti ni pepelnicu.

Šupljikavost zaražava list koji je, kako i ime kaže, pun manjih i većih šupljina, a zdravi listovi na voćkama su od izuzetne važnosti za visinu i kvalitet roda. Ako su oni bolesni, plodove nema ko da hrani, te i valjana oplodnja ne garantuje dobar rod. U ovom periodu još uvek su efikasni fungicidi kontaktnog delovanja kakvi su Merpan 50-WP, Captan 50-WP, Venturion, Metod 480-SC, Capi,  Pillarus 80-WG.

Gljiva izazivač pepelnice se najlakše otkriva tokom proređivanja plodova. Ukoliko postoji potreba, nektarine se oprskaju rastvorom fungicida Asord.